结局：影片最后两人的对话中，女主问：你不是Kane。答曰：不是。随即反问：你不是Lena。沉默，一个意味深长的对视，一个尽在不言中的相拥。这个结局已经很明显了，入侵获得了成功，地球源生物种的时代即将湮灭，而他们将是新世界的亚当和夏娃。
身份：女主莉娜正式转化成复制人 。
女银毕主来到灯塔，钻入地洞后发现湮灭成一团能量体的女领队。她的一滴血滴入其中，导致这团能量体变成了与她相同的样子。结合之前所有的讨论，这看似极其意识流的一幕便可以解释了。能量体，或者说物质团原先包含了足够表达一个成年人所需的能量。
在从血细胞中获得女主的基因序列后，利用这些能量迅速复制出了一个女主的克隆体。而之前走出X区的女主的丈夫，通过录像中获得的信息也就可以十分明确了，也并非本体。
annihilation，原意中也有彻底毁灭某事物，完全释放能量的含义，这也恰好对应了这一幕中女队长被彻底毁灭并转化成了能量体。至于血细胞不能在血液中分裂增殖，而是应该在骨髓中增殖这件事，就当做是诱导了血细胞回复多能性好了，毕竟那个细胞形态也不是正常的血细胞。
莉娜的丈夫凯恩是其中首位到达灯塔的人，在那里他无限接近“闪光”，被复制（分裂）、折射（变异）的概率大大增加，也大大加快，所以就出现了一个复制他的“复制体”。
美国媒体《娱乐周刊》赞其为：一场豪华的、令人惊叹的视觉盛宴，带来了真正的形而上学力量。有影迷裤陪认为，它拿下明年的奥斯卡视效奖是没什么问题了。
《湮灭》的小说属于克苏鲁神胡搏蠢话小说体系，一句话概括，就是这类型故事的角色，大都会通过探索或研究未知，从而进入死亡和疯癫。而且克苏鲁神话的风格，大部分是以悬疑，惊悚，恐怖的氛围为主，吊足观众胃口，让主角和观众同步解谜。
电影剔除了小说中人物复杂的心理活动和支线故事，结合后两部《当权者》和《接纳》，把小说《湮灭》没交代的谜题，在电影中具象表达出来，再加上视觉艺术上的呈现，可谓是美轮美奂，又不失文艺腔调。
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