在大城市比如上海的费用：全身是在7000元左右，局部大概要4000元左右；在北京，全身约9000-13000元，局部是要在6000-10000元左右；其他地区的费用与北京是相似的。由于PET-CT可分为全身检查还有局部检查的，PET-CT的成本是没有统一的要求。而且经济发展的不同还有其他原因，PET-CT的成本在不同地区有所不同。
只针对一个部位大约要花300到400元，若是强化检验，单一的部位大概是可以达到800-900元，是能够发现2毫米以上的实性病变。另外从三维成像的不同角度可以了解病变的形状、大小和外观，PETCT的成本通常很高。而且PETCT是目前医院最先进的影像学检查方法。与普通CT相比，准确度更高。
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