百分之九十的肠套叠找不到明显的发病原因，称之为“特发性”。腹泻、便秘、服用药物、上呼吸道感染、肠胃过敏与结肠蠕动力增加皆可能与之有关，另外有些学者认为在五岁半以内的婴儿由于大肠与小肠管径之比例相差大。故小肠易陷入大肠而被套牢。只有5％的肠套餐可以找到确实的解剖学上的异常（引导点）病因，包括美凯尔憩室、肠息肉、异位胰腺小结、血管瘤、异物、复制肠管、淋巴增生、肿瘤、寄生虫等，其中又以美凯尔憩室最多；另外过敏性紫斑也常会合并肠套叠，大于2岁的小孩发生肠套叠，一定要怀疑有这些“引导点”之可能。大于5岁的病例中，则以淋巴瘤为最多。你孩子的肠套需要找出原因才能根治.
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